Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ78

Pbk, Lymphokine-activated killer T-cell-originated protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbkQ9JJ78 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PbkQ9JJ78 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PbkQ9JJ78 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PbkQ9JJ78 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PbkQ9JJ78 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PbkQ9JJ78 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PbkQ9JJ78 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PbkQ9JJ78 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms