Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ26

Mefv, Pyrin, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MefvQ9JJ26 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MefvQ9JJ26 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MefvQ9JJ26 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MefvQ9JJ26 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MefvQ9JJ26 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MefvQ9JJ26 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MefvQ9JJ26 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MefvQ9JJ26 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MefvQ9JJ26 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MefvQ9JJ26 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MefvQ9JJ26 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MefvQ9JJ26 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MefvQ9JJ26 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MefvQ9JJ26 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MefvQ9JJ26 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MefvQ9JJ26 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MefvQ9JJ26 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MefvQ9JJ26 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MefvQ9JJ26 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MefvQ9JJ26 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MefvQ9JJ26 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MefvQ9JJ26 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MefvQ9JJ26 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MefvQ9JJ26 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms