Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RabggtaQ9JHK4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RabggtaQ9JHK4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RabggtaQ9JHK4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RabggtaQ9JHK4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RabggtaQ9JHK4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RabggtaQ9JHK4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RabggtaQ9JHK4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RabggtaQ9JHK4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RabggtaQ9JHK4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RabggtaQ9JHK4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RabggtaQ9JHK4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RabggtaQ9JHK4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RabggtaQ9JHK4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RabggtaQ9JHK4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RabggtaQ9JHK4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RabggtaQ9JHK4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RabggtaQ9JHK4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RabggtaQ9JHK4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RabggtaQ9JHK4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RabggtaQ9JHK4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RabggtaQ9JHK4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RabggtaQ9JHK4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RabggtaQ9JHK4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RabggtaQ9JHK4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RabggtaQ9JHK4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RabggtaQ9JHK4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RabggtaQ9JHK4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RabggtaQ9JHK4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RabggtaQ9JHK4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RabggtaQ9JHK4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RabggtaQ9JHK4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RabggtaQ9JHK4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RabggtaQ9JHK4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RabggtaQ9JHK4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RabggtaQ9JHK4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RabggtaQ9JHK4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RabggtaQ9JHK4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RabggtaQ9JHK4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RabggtaQ9JHK4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RabggtaQ9JHK4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
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