Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX5

Dkc1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkc1Q9ESX5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dkc1Q9ESX5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dkc1Q9ESX5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dkc1Q9ESX5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms