Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ms4a4bQ9ES61 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ms4a4bQ9ES61 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms