Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Clstn2Q9ER65 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Clstn2Q9ER65 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Clstn2Q9ER65 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Clstn2Q9ER65 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Clstn2Q9ER65 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Clstn2Q9ER65 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Clstn2Q9ER65 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Clstn2Q9ER65 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Clstn2Q9ER65 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Clstn2Q9ER65 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Clstn2Q9ER65 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Clstn2Q9ER65 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Clstn2Q9ER65 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Clstn2Q9ER65 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Clstn2Q9ER65 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Clstn2Q9ER65 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Clstn2Q9ER65 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Clstn2Q9ER65 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Clstn2Q9ER65 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Clstn2Q9ER65 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Clstn2Q9ER65 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Clstn2Q9ER65 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Clstn2Q9ER65 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Clstn2Q9ER65 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Clstn2Q9ER65 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Clstn2Q9ER65 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Clstn2Q9ER65 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Clstn2Q9ER65 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Clstn2Q9ER65 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Clstn2Q9ER65 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Clstn2Q9ER65 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Clstn2Q9ER65 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Clstn2Q9ER65 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Clstn2Q9ER65 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Clstn2Q9ER65 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Clstn2Q9ER65 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Clstn2Q9ER65 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Clstn2Q9ER65 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Clstn2Q9ER65 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Clstn2Q9ER65 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Clstn2Q9ER65 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Clstn2Q9ER65 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Clstn2Q9ER65 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Clstn2Q9ER65 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Clstn2Q9ER65 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Clstn2Q9ER65 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Clstn2Q9ER65 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Clstn2Q9ER65 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Clstn2Q9ER65 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Clstn2Q9ER65 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Clstn2Q9ER65 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Clstn2Q9ER65 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Clstn2Q9ER65 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Clstn2Q9ER65 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Clstn2Q9ER65 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Clstn2Q9ER65 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Clstn2Q9ER65 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Clstn2Q9ER65 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Clstn2Q9ER65 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Clstn2Q9ER65 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Clstn2Q9ER65 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Clstn2Q9ER65 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Clstn2Q9ER65 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Clstn2Q9ER65 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Clstn2Q9ER65 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Clstn2Q9ER65 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Clstn2Q9ER65 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Clstn2Q9ER65 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Clstn2Q9ER65 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Clstn2Q9ER65 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Clstn2Q9ER65 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Clstn2Q9ER65 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Clstn2Q9ER65 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Clstn2Q9ER65 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Clstn2Q9ER65 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Clstn2Q9ER65 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Clstn2Q9ER65 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Clstn2Q9ER65 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Clstn2Q9ER65 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Clstn2Q9ER65 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Clstn2Q9ER65 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Clstn2Q9ER65 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Clstn2Q9ER65 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Clstn2Q9ER65 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Clstn2Q9ER65 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Clstn2Q9ER65 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Clstn2Q9ER65 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Clstn2Q9ER65 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Clstn2Q9ER65 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Clstn2Q9ER65 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Clstn2Q9ER65 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Clstn2Q9ER65 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Clstn2Q9ER65 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Clstn2Q9ER65 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Clstn2Q9ER65 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Clstn2Q9ER65 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Clstn2Q9ER65 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Clstn2Q9ER65 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Clstn2Q9ER65 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms