Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM3

Nkx2-4, Homeobox protein Nkx-2.4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-4Q9EQM3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx2-4Q9EQM3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx2-4Q9EQM3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-4Q9EQM3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-4Q9EQM3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-4Q9EQM3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-4Q9EQM3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx2-4Q9EQM3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx2-4Q9EQM3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx2-4Q9EQM3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx2-4Q9EQM3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx2-4Q9EQM3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx2-4Q9EQM3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx2-4Q9EQM3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx2-4Q9EQM3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx2-4Q9EQM3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx2-4Q9EQM3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-4Q9EQM3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-4Q9EQM3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-4Q9EQM3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx2-4Q9EQM3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx2-4Q9EQM3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms