Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SgshQ9EQ08 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SgshQ9EQ08 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms