Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cbx6Q9DBY5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cbx6Q9DBY5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cbx6Q9DBY5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cbx6Q9DBY5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms