Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf6Q9DBU5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf6Q9DBU5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf6Q9DBU5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf6Q9DBU5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms