Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA83

1700018B08Rik, RIKEN cDNA 1700018B08, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018B08RikQ9DA83 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
1700018B08RikQ9DA83 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
1700018B08RikQ9DA83 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
1700018B08RikQ9DA83 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
1700018B08RikQ9DA83 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
1700018B08RikQ9DA83 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
1700018B08RikQ9DA83 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
1700018B08RikQ9DA83 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
1700018B08RikQ9DA83 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
1700018B08RikQ9DA83 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
1700018B08RikQ9DA83 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
1700018B08RikQ9DA83 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
1700018B08RikQ9DA83 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
1700018B08RikQ9DA83 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700018B08RikQ9DA83 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
1700018B08RikQ9DA83 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700018B08RikQ9DA83 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700018B08RikQ9DA83 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700018B08RikQ9DA83 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700018B08RikQ9DA83 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700018B08RikQ9DA83 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700018B08RikQ9DA83 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700018B08RikQ9DA83 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700018B08RikQ9DA83 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700018B08RikQ9DA83 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700018B08RikQ9DA83 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700018B08RikQ9DA83 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700018B08RikQ9DA83 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700018B08RikQ9DA83 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700018B08RikQ9DA83 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700018B08RikQ9DA83 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700018B08RikQ9DA83 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
1700018B08RikQ9DA83 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
1700018B08RikQ9DA83 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700018B08RikQ9DA83 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
1700018B08RikQ9DA83 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms