Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z1

Knstrn, Small kinetochore-associated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KnstrnQ9D9Z1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KnstrnQ9D9Z1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KnstrnQ9D9Z1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KnstrnQ9D9Z1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KnstrnQ9D9Z1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KnstrnQ9D9Z1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KnstrnQ9D9Z1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KnstrnQ9D9Z1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KnstrnQ9D9Z1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KnstrnQ9D9Z1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KnstrnQ9D9Z1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KnstrnQ9D9Z1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KnstrnQ9D9Z1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KnstrnQ9D9Z1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KnstrnQ9D9Z1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KnstrnQ9D9Z1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KnstrnQ9D9Z1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KnstrnQ9D9Z1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KnstrnQ9D9Z1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KnstrnQ9D9Z1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KnstrnQ9D9Z1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KnstrnQ9D9Z1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KnstrnQ9D9Z1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KnstrnQ9D9Z1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KnstrnQ9D9Z1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KnstrnQ9D9Z1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KnstrnQ9D9Z1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KnstrnQ9D9Z1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KnstrnQ9D9Z1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KnstrnQ9D9Z1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KnstrnQ9D9Z1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KnstrnQ9D9Z1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KnstrnQ9D9Z1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KnstrnQ9D9Z1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KnstrnQ9D9Z1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KnstrnQ9D9Z1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KnstrnQ9D9Z1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KnstrnQ9D9Z1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KnstrnQ9D9Z1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KnstrnQ9D9Z1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KnstrnQ9D9Z1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KnstrnQ9D9Z1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KnstrnQ9D9Z1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KnstrnQ9D9Z1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KnstrnQ9D9Z1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KnstrnQ9D9Z1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KnstrnQ9D9Z1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KnstrnQ9D9Z1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KnstrnQ9D9Z1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KnstrnQ9D9Z1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KnstrnQ9D9Z1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KnstrnQ9D9Z1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KnstrnQ9D9Z1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KnstrnQ9D9Z1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KnstrnQ9D9Z1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KnstrnQ9D9Z1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KnstrnQ9D9Z1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KnstrnQ9D9Z1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KnstrnQ9D9Z1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KnstrnQ9D9Z1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KnstrnQ9D9Z1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms