Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calr3Q9D9Q6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calr3Q9D9Q6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calr3Q9D9Q6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calr3Q9D9Q6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calr3Q9D9Q6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calr3Q9D9Q6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Calr3Q9D9Q6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calr3Q9D9Q6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calr3Q9D9Q6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calr3Q9D9Q6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calr3Q9D9Q6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calr3Q9D9Q6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Calr3Q9D9Q6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calr3Q9D9Q6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calr3Q9D9Q6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calr3Q9D9Q6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calr3Q9D9Q6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calr3Q9D9Q6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calr3Q9D9Q6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms