Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf138rt1Q9D9M9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms