Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vstm5Q9D806 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vstm5Q9D806 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vstm5Q9D806 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms