Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slx4ipQ9D7Y9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slx4ipQ9D7Y9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slx4ipQ9D7Y9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slx4ipQ9D7Y9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slx4ipQ9D7Y9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slx4ipQ9D7Y9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slx4ipQ9D7Y9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slx4ipQ9D7Y9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slx4ipQ9D7Y9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slx4ipQ9D7Y9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slx4ipQ9D7Y9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms