Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan17Q9D7W4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan17Q9D7W4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tspan17Q9D7W4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms