Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7M8

Polr2d, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2dQ9D7M8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr2dQ9D7M8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr2dQ9D7M8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr2dQ9D7M8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr2dQ9D7M8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Polr2dQ9D7M8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr2dQ9D7M8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr2dQ9D7M8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr2dQ9D7M8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms