Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D7E4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D7E4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D7E4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D7E4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D7E4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D7E4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9D7E4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D7E4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D7E4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D7E4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D7E4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D7E4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D7E4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms