Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cfap53Q9D439 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cfap53Q9D439 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfap53Q9D439 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap53Q9D439 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap53Q9D439 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap53Q9D439 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap53Q9D439 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap53Q9D439 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap53Q9D439 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap53Q9D439 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap53Q9D439 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap53Q9D439 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap53Q9D439 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap53Q9D439 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap53Q9D439 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap53Q9D439 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap53Q9D439 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap53Q9D439 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap53Q9D439 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap53Q9D439 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap53Q9D439 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfap53Q9D439 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfap53Q9D439 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfap53Q9D439 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap53Q9D439 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap53Q9D439 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap53Q9D439 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap53Q9D439 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfap53Q9D439 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms