Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
4933428M09RikQ9D3X3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4933428M09RikQ9D3X3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
4933428M09RikQ9D3X3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 211.8 ms