Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H9

Dnaaf1, Dynein assembly factor 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf1Q9D2H9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Dnaaf1Q9D2H9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dnaaf1Q9D2H9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnaaf1Q9D2H9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms