Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chordc1Q9D1P4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chordc1Q9D1P4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chordc1Q9D1P4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chordc1Q9D1P4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chordc1Q9D1P4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chordc1Q9D1P4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chordc1Q9D1P4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chordc1Q9D1P4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chordc1Q9D1P4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chordc1Q9D1P4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chordc1Q9D1P4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chordc1Q9D1P4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chordc1Q9D1P4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chordc1Q9D1P4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chordc1Q9D1P4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chordc1Q9D1P4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chordc1Q9D1P4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 192.2 ms