Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R4

Ddx56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx56Q9D0R4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx56Q9D0R4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx56Q9D0R4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx56Q9D0R4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddx56Q9D0R4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx56Q9D0R4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddx56Q9D0R4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx56Q9D0R4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx56Q9D0R4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx56Q9D0R4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx56Q9D0R4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddx56Q9D0R4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddx56Q9D0R4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ddx56Q9D0R4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms