Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc8Q9CYA6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Zcchc8Q9CYA6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zcchc8Q9CYA6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zcchc8Q9CYA6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zcchc8Q9CYA6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zcchc8Q9CYA6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zcchc8Q9CYA6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zcchc8Q9CYA6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc8Q9CYA6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc8Q9CYA6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc8Q9CYA6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc8Q9CYA6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zcchc8Q9CYA6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc8Q9CYA6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc8Q9CYA6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc8Q9CYA6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zcchc8Q9CYA6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zcchc8Q9CYA6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms