Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ChtopQ9CY57 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChtopQ9CY57 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms