Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gadd45gip1Q9CR59 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gadd45gip1Q9CR59 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gadd45gip1Q9CR59 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gadd45gip1Q9CR59 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gadd45gip1Q9CR59 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gadd45gip1Q9CR59 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gadd45gip1Q9CR59 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gadd45gip1Q9CR59 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gadd45gip1Q9CR59 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gadd45gip1Q9CR59 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gadd45gip1Q9CR59 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gadd45gip1Q9CR59 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gadd45gip1Q9CR59 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gadd45gip1Q9CR59 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gadd45gip1Q9CR59 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gadd45gip1Q9CR59 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gadd45gip1Q9CR59 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gadd45gip1Q9CR59 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gadd45gip1Q9CR59 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gadd45gip1Q9CR59 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gadd45gip1Q9CR59 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gadd45gip1Q9CR59 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gadd45gip1Q9CR59 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gadd45gip1Q9CR59 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gadd45gip1Q9CR59 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gadd45gip1Q9CR59 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gadd45gip1Q9CR59 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gadd45gip1Q9CR59 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gadd45gip1Q9CR59 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gadd45gip1Q9CR59 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gadd45gip1Q9CR59 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gadd45gip1Q9CR59 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gadd45gip1Q9CR59 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gadd45gip1Q9CR59 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gadd45gip1Q9CR59 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gadd45gip1Q9CR59 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gadd45gip1Q9CR59 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gadd45gip1Q9CR59 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms