Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mid1ip1Q9CQ20 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms