Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim3Q99PE5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smim3Q99PE5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim3Q99PE5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms