Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cntnap4Q99P47 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cntnap4Q99P47 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms