Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PtprtQ99M80 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PtprtQ99M80 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PtprtQ99M80 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
PtprtQ99M80 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
PtprtQ99M80 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
PtprtQ99M80 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PtprtQ99M80 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PtprtQ99M80 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PtprtQ99M80 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PtprtQ99M80 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PtprtQ99M80 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PtprtQ99M80 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PtprtQ99M80 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
PtprtQ99M80 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PtprtQ99M80 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PtprtQ99M80 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PtprtQ99M80 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PtprtQ99M80 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PtprtQ99M80 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PtprtQ99M80 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PtprtQ99M80 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PtprtQ99M80 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PtprtQ99M80 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PtprtQ99M80 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PtprtQ99M80 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PtprtQ99M80 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PtprtQ99M80 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PtprtQ99M80 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PtprtQ99M80 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PtprtQ99M80 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PtprtQ99M80 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PtprtQ99M80 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PtprtQ99M80 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PtprtQ99M80 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PtprtQ99M80 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PtprtQ99M80 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PtprtQ99M80 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PtprtQ99M80 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PtprtQ99M80 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
PtprtQ99M80 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
PtprtQ99M80 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
PtprtQ99M80 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PtprtQ99M80 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PtprtQ99M80 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PtprtQ99M80 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
PtprtQ99M80 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PtprtQ99M80 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PtprtQ99M80 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PtprtQ99M80 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PtprtQ99M80 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC33.8■■■■□ 3
PtprtQ99M80 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PtprtQ99M80 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PtprtQ99M80 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PtprtQ99M80 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PtprtQ99M80 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PtprtQ99M80 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
PtprtQ99M80 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PtprtQ99M80 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PtprtQ99M80 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PtprtQ99M80 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PtprtQ99M80 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
PtprtQ99M80 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
PtprtQ99M80 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PtprtQ99M80 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PtprtQ99M80 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PtprtQ99M80 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PtprtQ99M80 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PtprtQ99M80 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PtprtQ99M80 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
PtprtQ99M80 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
PtprtQ99M80 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
PtprtQ99M80 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PtprtQ99M80 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PtprtQ99M80 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PtprtQ99M80 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PtprtQ99M80 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PtprtQ99M80 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PtprtQ99M80 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PtprtQ99M80 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PtprtQ99M80 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PtprtQ99M80 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PtprtQ99M80 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PtprtQ99M80 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
PtprtQ99M80 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PtprtQ99M80 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
PtprtQ99M80 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
PtprtQ99M80 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PtprtQ99M80 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PtprtQ99M80 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PtprtQ99M80 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PtprtQ99M80 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PtprtQ99M80 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PtprtQ99M80 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PtprtQ99M80 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PtprtQ99M80 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PtprtQ99M80 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PtprtQ99M80 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PtprtQ99M80 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PtprtQ99M80 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
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