Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM3

Smtnl1, Smoothelin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smtnl1Q99LM3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smtnl1Q99LM3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Smtnl1Q99LM3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smtnl1Q99LM3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.6 ms