Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Reep3Q99KK1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Reep3Q99KK1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Reep3Q99KK1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Reep3Q99KK1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Reep3Q99KK1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Reep3Q99KK1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Reep3Q99KK1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Reep3Q99KK1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Reep3Q99KK1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Reep3Q99KK1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Reep3Q99KK1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Reep3Q99KK1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Reep3Q99KK1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Reep3Q99KK1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Reep3Q99KK1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Reep3Q99KK1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Reep3Q99KK1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Reep3Q99KK1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Reep3Q99KK1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Reep3Q99KK1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Reep3Q99KK1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Reep3Q99KK1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Reep3Q99KK1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Reep3Q99KK1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Reep3Q99KK1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms