Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdcbp2Q99JZ0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdcbp2Q99JZ0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdcbp2Q99JZ0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdcbp2Q99JZ0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdcbp2Q99JZ0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdcbp2Q99JZ0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdcbp2Q99JZ0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdcbp2Q99JZ0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdcbp2Q99JZ0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdcbp2Q99JZ0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdcbp2Q99JZ0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdcbp2Q99JZ0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sdcbp2Q99JZ0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sdcbp2Q99JZ0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdcbp2Q99JZ0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdcbp2Q99JZ0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdcbp2Q99JZ0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdcbp2Q99JZ0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sdcbp2Q99JZ0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdcbp2Q99JZ0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms