Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spdl1Q923A2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spdl1Q923A2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spdl1Q923A2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms