Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Smarca5Q91ZW3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Smarca5Q91ZW3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarca5Q91ZW3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarca5Q91ZW3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarca5Q91ZW3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarca5Q91ZW3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarca5Q91ZW3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarca5Q91ZW3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Smarca5Q91ZW3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarca5Q91ZW3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarca5Q91ZW3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarca5Q91ZW3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarca5Q91ZW3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Smarca5Q91ZW3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca5Q91ZW3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca5Q91ZW3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca5Q91ZW3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca5Q91ZW3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smarca5Q91ZW3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarca5Q91ZW3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarca5Q91ZW3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarca5Q91ZW3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarca5Q91ZW3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca5Q91ZW3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca5Q91ZW3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca5Q91ZW3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca5Q91ZW3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca5Q91ZW3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca5Q91ZW3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca5Q91ZW3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smarca5Q91ZW3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 236.7 ms