Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY7

Pcdhga12, Protocadherin gamma A12, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga12Q91XY7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcdhga12Q91XY7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcdhga12Q91XY7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcdhga12Q91XY7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcdhga12Q91XY7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcdhga12Q91XY7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcdhga12Q91XY7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcdhga12Q91XY7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcdhga12Q91XY7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcdhga12Q91XY7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcdhga12Q91XY7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcdhga12Q91XY7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcdhga12Q91XY7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcdhga12Q91XY7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcdhga12Q91XY7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcdhga12Q91XY7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcdhga12Q91XY7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcdhga12Q91XY7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcdhga12Q91XY7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcdhga12Q91XY7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pcdhga12Q91XY7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pcdhga12Q91XY7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms