Protein–RNA interactions for Protein: Q91WM3

Rrp9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp9Q91WM3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrp9Q91WM3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrp9Q91WM3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrp9Q91WM3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrp9Q91WM3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrp9Q91WM3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrp9Q91WM3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrp9Q91WM3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrp9Q91WM3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rrp9Q91WM3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrp9Q91WM3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrp9Q91WM3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rrp9Q91WM3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrp9Q91WM3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrp9Q91WM3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrp9Q91WM3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrp9Q91WM3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rrp9Q91WM3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrp9Q91WM3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrp9Q91WM3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rrp9Q91WM3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrp9Q91WM3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrp9Q91WM3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rrp9Q91WM3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrp9Q91WM3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrp9Q91WM3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rrp9Q91WM3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rrp9Q91WM3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rrp9Q91WM3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rrp9Q91WM3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rrp9Q91WM3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rrp9Q91WM3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rrp9Q91WM3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rrp9Q91WM3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rrp9Q91WM3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rrp9Q91WM3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rrp9Q91WM3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms