Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Smg8Q8VE18 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smg8Q8VE18 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg8Q8VE18 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg8Q8VE18 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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