Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BbxQ8VBW5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BbxQ8VBW5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BbxQ8VBW5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms