Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc12Q8R344 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc12Q8R344 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc12Q8R344 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms