Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K4

Ccdc137, Coiled-coil domain-containing protein 137, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc137Q8R0K4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc137Q8R0K4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc137Q8R0K4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc137Q8R0K4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc137Q8R0K4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc137Q8R0K4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc137Q8R0K4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc137Q8R0K4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc137Q8R0K4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc137Q8R0K4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc137Q8R0K4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc137Q8R0K4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc137Q8R0K4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc137Q8R0K4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc137Q8R0K4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc137Q8R0K4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc137Q8R0K4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc137Q8R0K4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc137Q8R0K4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc137Q8R0K4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc137Q8R0K4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc137Q8R0K4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc137Q8R0K4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc137Q8R0K4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc137Q8R0K4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc137Q8R0K4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc137Q8R0K4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc137Q8R0K4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc137Q8R0K4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc137Q8R0K4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc137Q8R0K4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms