Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D5

Gfm1, Elongation factor G, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfm1Q8K0D5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfm1Q8K0D5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gfm1Q8K0D5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfm1Q8K0D5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms