Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip10Q8CJ53 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip10Q8CJ53 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trip10Q8CJ53 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip10Q8CJ53 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip10Q8CJ53 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip10Q8CJ53 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip10Q8CJ53 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip10Q8CJ53 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trip10Q8CJ53 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trip10Q8CJ53 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip10Q8CJ53 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 273.1 ms