Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nupl2Q8CIC2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nupl2Q8CIC2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nupl2Q8CIC2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nupl2Q8CIC2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nupl2Q8CIC2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nupl2Q8CIC2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nupl2Q8CIC2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nupl2Q8CIC2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nupl2Q8CIC2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nupl2Q8CIC2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms