Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc28aQ8CEI3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc28aQ8CEI3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms