Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp27Q8CEG8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp27Q8CEG8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp27Q8CEG8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp27Q8CEG8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp27Q8CEG8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp27Q8CEG8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp27Q8CEG8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp27Q8CEG8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp27Q8CEG8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp27Q8CEG8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp27Q8CEG8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp27Q8CEG8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp27Q8CEG8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp27Q8CEG8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp27Q8CEG8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp27Q8CEG8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp27Q8CEG8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp27Q8CEG8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp27Q8CEG8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp27Q8CEG8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp27Q8CEG8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp27Q8CEG8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp27Q8CEG8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 499.2 ms