Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rsph6aQ8CDR2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rsph6aQ8CDR2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rsph6aQ8CDR2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rsph6aQ8CDR2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rsph6aQ8CDR2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rsph6aQ8CDR2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rsph6aQ8CDR2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rsph6aQ8CDR2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rsph6aQ8CDR2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rsph6aQ8CDR2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rsph6aQ8CDR2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rsph6aQ8CDR2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rsph6aQ8CDR2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rsph6aQ8CDR2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rsph6aQ8CDR2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rsph6aQ8CDR2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rsph6aQ8CDR2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rsph6aQ8CDR2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rsph6aQ8CDR2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rsph6aQ8CDR2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rsph6aQ8CDR2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rsph6aQ8CDR2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Rsph6aQ8CDR2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rsph6aQ8CDR2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rsph6aQ8CDR2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Rsph6aQ8CDR2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rsph6aQ8CDR2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rsph6aQ8CDR2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Rsph6aQ8CDR2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rsph6aQ8CDR2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rsph6aQ8CDR2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rsph6aQ8CDR2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rsph6aQ8CDR2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rsph6aQ8CDR2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rsph6aQ8CDR2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rsph6aQ8CDR2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms