Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY02

Nkrf, NF-kappa-B-repressing factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkrfQ8BY02 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NkrfQ8BY02 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NkrfQ8BY02 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NkrfQ8BY02 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms