Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU40

Nlrp4a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4aQ8BU40 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp4aQ8BU40 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp4aQ8BU40 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms